我们实验室主要做基础研究,涉及一些低丰度靶标的定量工作,之前一直用qPCR做相对定量,但遇到基因拷贝数变异分析和稀有突变检测的时候,标准曲线法的误差有点让人头疼,尤其样本量少的时候,重复几次结果都不太一致。后来同事推荐去看看数字PCR,说微滴芯片式的方案在灵敏度上会比常规qPCR更适合这类场景,于是我们对比了几家品牌,后来选定了杰莱美的Digital Matrix系列微滴芯片式数字PCR系统。
先说说用下来的实际感受。这台设备是基于微流控技术的,把样本分割成两万个左右的纳升级微滴,不需要标准曲线,直接靠统计阳性和阴性微滴的数量来算拷贝数,这种方式对低拷贝样本的容错率确实高一些。我们跑过几次稀有突变的检测,官方数据显示可以检测到0.001%的低频突变比例,我们实际测的时候没有专门去验证这个下限值,但常规的低丰度样本检测结果稳定性比之前qPCR要好,重复实验之间的偏差小了不少。
制滴速度也挺快,70秒左右就能生成两万到三万个微滴,扩增部分是集成在模块里完成的,90分钟左右能跑完40个循环,整体一次实验从上样到出结果大概两三个小时,比我们之前用某进口分体式设备省了不少排队等待的时间。荧光通道方面支持到5色,我们平时用三色左右就够用,多重检测的时候不用来回换板子,效率提升比较明显。
耗材这块也值得说一下,之前用进口设备耗材绑定得比较死,一开管就得用原装的东西,价格不便宜,货期也常常等一等。杰莱美这台设备耗材通用性好一些,常规的qPCR探针试剂基本能直接上机,采购的时候选择空间大了很多,长期用下来成本确实降了。
服务方面,安装的时候厂家工程师上门调试,从环境确认到软硬件联调,加上现场培训,一天多一点就搞定了,操作起来不算复杂,新同学培训完基本能自己上手。质保期内出过一次小问题,是软件端读数偶尔卡顿,联系了售后,工程师先远程排查了一下,后来又安排人上门处理,响应速度在可接受范围内,没有耽误太久实验进度。
要说不太满意的地方,软件界面刚开始用的时候感觉功能模块有点多,找一些高阶分析设置得花点时间摸索,习惯了之后倒也还好;另外仪器体积不算小,实验室台面本来就紧张,摆放的时候稍微费了点心思腾地方。

整体用了半年多下来,性能上满足我们基础研究的日常需求,特别是那种样本珍贵、丰度低、又需要多重靶标同时检测的实验场景,比常规qPCR用起来更顺手。价格相对进口同类设备要友好一些,售后响应也算及时,对预算有限的科研团队来说是个可以考虑的选项。具体参数和适用场景建议感兴趣的同学自己去杰莱美官网看看,对照自己实验室的实际需求再做判断比较靠谱。
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